Holoenzim Bileşenleri: (1) Çekirdek Enzim ve (2) Sigma Faktörü

E. coli komple RNA polimerazı, holoenzim olarak bilinir. Holenzim, aşağıdaki iki bileşenden oluşur: (1) çekirdek enzim ve (2) sigma faktörü. Holoenzim a ₂ β β 'σ olarak sembolize edilebilir. !

1. Çekirdek Enzim:

Çekirdek enzim, uygun bölgelerde transkripsiyonu başlatamaz, ancak bir şablon olarak DNA kullanarak RNA'yı sentezleyebilir.

Çekirdek RNA polimerazı, aşağıdaki üç tipteki dört polipeptitten oluşur:

(a) α alt birimi:

İki kopya / çekirdek enzim molekülünde bulunur ve promotör DNA ile bağlanma ile ilgilidir. DNA ile bağlanmasının kesin mekanizması bilinmemektedir.

(b) β alt birim:

Tek bir kopya / enzim molekülünde bulunur ve RNA sentezi için gelen nükleotitlerle bağlanmaya katılır. DNA bazları karşısındaki doğru nükleotidlerin tanınması, bazların eşleme davranışına değil, birbirlerine göre genel geometrilerine dayanıyor gibi görünmektedir.

(c) β 'alt birimi:

DNA şablonuna, yani transkripsiyonun ilerlemesine izin vermek için üretilen tek iplikli DNA şeridi ile bağlanmaya katılır.

Her alt birim, en azından aşağıdaki dört ayrı fonksiyonel bölgeye sahip olması gereken, çekirdek enzimin bir bütün olarak işlevine katkıda bulunur.

(i) Çekirdek enzimi, kopyalanmakta olan DNA boyunca bir bazda hareket ederken, DNA çift yönlü çözücüsünü tutan bir DNA gevşetme bölgesi.

(ii) “Antisens iplikçik” e bağlanan bölge, kopyalanan iplikçik.

(iii) Başka bir alan, transkripsiyonu yapılan DNA'nın “antisens ipliği” ni tamamlayan 'duyu ipliği' ne bağlanır.

(iv) Bir DNA geri sarma bölgesi, iki DNA şeridini normal bir çift yüze geri sarmakla ilgilidir.

2. Sigma Faktörü:

Sigma faktörü, RNA polimerazının promotör DNA'ya stabil bağlanmasında rol oynar; ve muhtemelen transkripsiyon başlangıcı ile. RNA zinciri 8-9 bazlara ulaştığında salındığı için kendi başına transkripsiyona dahil değildir (yani, RNA sentezi); çekirdek enzim daha sonra transkripsiyona devam eder.

Ökaryotlarda RNA Polimerazı:

Tüm ökaryotlar, RNA polimeraz I, RNA polimeraz II ve RNA polimeraz III adı verilen üç ayrı RNA polimeraz sınıfına sahiptir.

RNA polimeraz I:

Bu enzim nükleolde bulunur ve ribozomal RNA'nın transkripsiyonundan sorumludur.

RNA polimeraz II:

Bu polimeraz, nükleolus dışındaki çekirdeğin bir parçası olan nükleolazmada bulunur. Bu enzim, RNA polimeraz aktivitesinin ana bileşenidir ve mRNA üreten tüm genleri kopyalar. Ökaryotlarda transkript başlangıçta, daha sonra mRNA'da işlenen, heterojen nükleer RNA (hn RNA) olarak adlandırılan mRNA öncüleri formundadır.

RNA polimeraz III:

Bu enzim nükleoplazmada ortaya çıkar ve tRNA ve 5S RNA genlerini kopyalar.

Organellar RNA polimeraz:

Nükleer RNA polimeraz I, II ve III'e ek olarak, ökaryotik hücreler organellerinde, yani mitokondri ve plastidlerinde az miktarda RNA polimeraz aktivitesine sahiptir. Bu polimerazlara, bu organellerde bulunan nispeten az sayıda genin transkripsiyonu için ihtiyaç duyulur. Bu enzimlerin faj RNA polimerazlarına benzer olduğu görülmektedir.