Enzim Papain ve Enzim Pepsin ile ilgili faydalı notlar

İmmünoglobulin, proteinlerdir ve genellikle enzimler tarafından sindirime karşı dirençlidir.

Bununla birlikte, papain ve pepsin enzimi immünoglobulin moleküllerini ayırır. Papain ve pepsin tarafından oluşturulan fragmanlar immünoglobülin yapısı ve fonksiyonları üzerine çalışmalar için faydalıdır. Ancak bu iki enzimin ayrılma yerleri farklıdır (Şekil 9.5).

Şekil 9.5: İmmunoglobülinin proteolitik fragmantasyonunun, papain ve pepsin enzimleriyle kısa süreli muamele ile şematik diyagramı.

Enzim papain, ağır zincir disülfit bağının N-terminal tarafındaki immünoglobülini ayırır ve üç fragman (iki Fab fragmanı ve bir Fc fragmanı) üretir. Enzim pepsini, C-terminal bölgesinde immünoglobülini ayırır ve F (ab ') 2 olarak adlandırılan büyük bir parça (iki Fab bölgesi içeren) üretir. C-terminal tarafındaki kalan ağır zincirler çok sayıda küçük peptide bölünür

1. Enzim Papain:

Enzim papain, ağır zincir disülfidlerinin N-terminal tarafındaki menteşe bölgesini ayırır ve bu üç parçanın oluşmasına neden olur. (Değişken bölgeyi içeren iki fragman ve C2 ve CH3 bölgelerini içeren bir fragman). Değişken bölgeyi içeren iki parça; Fab fragmanları (yani fragman antijen bağlanması), antijen bağlanma alanlarına sahip olduklarından.

Üçüncü fragman, disülfitlerle bir arada tutulan her iki ağır zincirin karboksil terminal kısımlarını içerir. Genel olarak üçüncü fragmanın yapısı, birçok farklı immünoglobülin molekülü için aynıdır.

Dolayısıyla, bu tiplerin fragmanları, birçok farklı immünoglobülinden oluşsa bile kristalize edilebilir. Bu nedenle, bu parçaya kristalize edilebilir parça ya da Fc parça adı verilir. İmmünoglobülinin sekonder biyolojik özelliklerinin çoğu Fc bölgesindeki dizilere bağlıdır. Ayrıca bu, Fc reseptörleri tarafından birçok hücre tipinde tanınan bölgedir.

2. Enzim Pepsini:

Enzim pepsini, menteşe bölgesinin karboksi terminal tarafındaki immünoglobulini parçalayarak F (ab ') 2 adı verilen büyük bir fragmana neden olur. F (ab ') 2, disülfit bağlarıyla bağlanmış iki Fab parçasına sahiptir. Fc bölgesi, pepsin tarafından geniş ölçüde bozunur ve genellikle, pepsin sindiriminden sonra bozulmamış bir Fc fragmanı kalmaz.