İmmunojenlerin Epitopu ile ilgili faydalı notlar

İmmunojenlerin Epitopu ile ilgili faydalı notlar!

İmmünojenlerin çoğu, birçok molekül tipinden oluşur.

Bununla birlikte, bu moleküllerin sadece birkaçı immünojen olarak hareket eder. Tek bir immünojenik molekül içinde bile, immün yanıt, tüm moleküle karşı değil, sadece molekül içindeki birkaç amino asit tortusuna karşı yönlendirilir.

İmmünoglobulin veya T hücre reseptörü (TCR) tarafından tanınan amino asit setine epitop (daha önce antijenik determinant adı verilir) denir. Tek bir immünojenik molekül, bir veya daha fazla farklı epitopa sahip olabilir (Şekil 6.1).

Şekil 6.1: Bir antijen içindeki farklı epitopların varlığını gösteren diyagram.

Bu şemada, bir antijende üç farklı epitop gösterilmektedir. Peptit epitopları, amino asit dizilimleri ile birbirlerinden farklılık gösterir ve sonuç olarak 3 boyutlu yapılarında farklılık gösterir. Epitoplar birbirlerinden farklılık gösterdiğinden, epitoplara karşı indüklenen antikorlar da kendi aralarında farklılık gösterir. Bir B hücresi üzerindeki yüzey immünoglobülini (slg; B hücresi reseptörü) bir epitopa bağlanır ve bağlanma, epitop amino asitleri ve slg'nin hiperdeğişken bölgesindeki tamamlayıcı amino asit sekansları arasında meydana gelir.

Protein amino asit kalıntıları, kompakt kütlelere katlanma eğilimindedir. Her bir proteinin genel katlama düzeni katıdır. Böylece katlanmış kütlenin yüzeyinde açığa çıkan amino asit kalıntıları birbirlerine göre sabit yerleri işgal eder. X ışını kristalogramları, antikorların, bir protein antijeninin yüzeyindeki amino asit kalıntıları ile temas ettiğini göstermiştir. Her antikorun temas ettiği amino asitlerin sayısı 3-20 arasında değişmektedir.

ben. Birçok durumda, bir epitopun tüm amino asit kalıntıları doğrusal olarak uzanır. Bu epitoplara doğrusal (veya sıralı) epitoplar denir. Isı denatürasyonu, kalıntıların doğrusal bir epitoptaki pozisyonlarını değiştirmez. Dolayısıyla, ısınmadan sonra bile, doğrusal epitoplar, karşılık gelen antikorları ile birleşir (Şekil 6.2).

ii. Oysa bazı epitoplar doğrusal amino asitlerden oluşmaz. Amino asit zincirinin katlanma doğası nedeniyle, zincirin farklı yerlerinden amino asitler birbirine yaklaşır. Bir epitop, polipeptit zincirinin farklı kısımlarından amino asitlerle oluşturulabilir ve birbirine yakın yerleştirilebilir. Bu epitop tipine konformasyonel epitop denir.

Konformasyonal epitopu oluşturan amino asit kalıntıları primer amino asit dizisinde birbirinden uzaktır, ancak üçüncül yapı içinde birbirine yakın yerleştirilir. Konformasyonal epitopa sahip bir protein ısıtıldığında, protein zincirinin denatürasyonu meydana gelir ve amino asit zinciri üç boyutlu katlamayı gevşetir. Epitopu oluşturan amino asitler, ısı nedeniyle birbirlerinden ayrılır ve sonuç olarak epitop kaybolur. Bu nedenle, konformasyonel epitopa karşı oluşturulan antikorlar denatüre antijene bağlanamaz (Şekil 6.2).